AFNI培训正式通知.pdf [高级下载] (704 K) 下载次数:43 应中科院心理研究所脑高级功能实验室的邀请，AFNI开发团队的原班人马(Cox, Reynolds, Gang Chen)，将于2010年4月12——16日，在北京中科院心理研究所为您精彩讲解AFNI的原理、操作和深入应用（详情请见通知）。







中科院心理研究所脑高级功能实验室



2010年3月

不大懂这个哦。。
楼主可以先科普一下anfi不？

钱啊钱啊

是翁旭初研究员邀请的，时间2010年4月12日-16日

水滴少的不用下附件，不过因是我直接从pdf中拷出来的，可能有些错行

中 国 科 学 院 心 理 研 究 所
脑 高 级 功 能 研 究 实 验 室
Laboratory for Higher Brain Function,
Institute of Psychology, Chinese Academy of Sciences
Beijing，China. 100101. Tel: 086-010-64836689
AFNI 软件高级功能使用培训会邀请函
AFNI以其从代码、算法到处理过程的透明性，在fMRI领域中独树一帜，已成为最受欢
迎的软件之一。它还拥有如下卓越性能：
 时间上：time course 一览无遗，数据质量和实验结果了然于胸
 空间上：立体三矢面随心选择，标准空间和个体原始空间相结合，可靠定位
 多被试：同时浏览、对比多个被试的结果
 GLM、Granger causality…fMRI、DTI…
 强大的网上message board提供全方位的支持，全球用户、专家共享心得和智慧
 软件完全免费！
中科院心理研究所脑高级功能实验室特邀AFNI 开发团队的原班人马(Cox, Reynolds,
Gang Chen，见附录3)为您精彩讲解AFNI 的原理、操作和深入应用，提供最原汁原味的技
术盛餐！
本次培训会将由陈刚老师（华人）亲自带队，无须担心语言沟通上的障碍。
为保证培训和上机实习质量，学员限额50 人，欲报从速。
一、报名方式
2010年4月8日前接受参会回执和预定， 请将回执表（附录1）发送到lijw@psych.ac.cn，
联系电话：（010）64836689或（010）64854476（李老师）。
二、报到方式
2010 年4 月11 日下午1 点起： 参会者注册、报到、缴纳培训费用、领取相应材料(中
科院心理所503 李老师)，系统安装(中科院心理所519)。
收费标准：在职人员：人民币2500 元/人，在读学生：人民币2000 元/人(在读学生请持
有效学生证注册)，会议主办方提供有效的报销票据。
参会者食、宿、交通费用自理（附录6 中推荐了心理所附近一些酒店或者宾馆，仅供参
考）。
三、培训安排
2010 年4 月12 日-16 日，全天培训（详见附录2）。
授课地点：北京市朝阳区大屯路甲4 号 中国科学院心理研究所东楼104 室（附录5 标
注了中科院心理所地理位置）。
四、电脑配置
培训过程中安排了现场练习环节，请参会者自带笔记本电脑。电脑硬件配置要求如下：
2G 以上内存，如果有装Windows 操作系统，请空出20G 左右的空间装linux，主分区
不多于3 个(安装过程参见附录4)。
如有疑难可联系：（010）64836689 或cbreal159@gmail.com（陈老师），也可于报到时
由我方协助安装。
中国科学院心理研究所脑高级功能实验室
2010 年3 月1 日
附录1 回执单
回执：
中国科学院心理研究所脑高级功能实验室
2010 年3 月1 日
姓 名 年 龄 性 别
工作单位
通信地址 邮 编
手 机 传 真 电子信箱
备 注
附录2： 主讲内容及时间安排(具体以当日发放的课程表为准)
附录3： 主要培训专家介绍
AFNI 主页 http://afni.nimh.nih.gov/afni/
Robert W Cox (小组主任)
自 2001 年担任美国国家精神卫生院(NIMH)科学运算与统
计小组主任，带领9 人的小组，开发并维护功能性核磁共振成像
的数据分析软件AFNI (http://afni.nimh.nih.gov/)， 免费为美国及
世界各地众多大学院校与研究单位的使用提供教育培训、合作与
咨询、在线讨论等服务。
Dr. Cox 并于 2007 年7 月获得 The Blueprint for
Neuroscience Research Director’s Award
Richard Reynolds (计算机专家)
AFNI 小组的元老与核心成员之一，主要担任用户接口设计、
问题回馈与建议、实验设计，数据分析咨询等。
Gang Chen (数理统计专家)
在 2003 年加入AFNI 小组，主要的工作是提供数据分析咨
询，开发高级的统计分析软件工具，包括组分析，路径分析，相
关性分析，高阶多元回归等。
附录4： 软件环境配置步骤
1. 磁盘容量调整
使用分区软件(Acronis Disk Director Suite 或ParitionMagic)或者系统自带的磁盘管理
工具进行分区。
如使用PQ 查看磁盘容量，假设现有磁盘空间类似如图1:
将磁盘空间调整为
创建新的磁盘分区如图
然后点击应用
点击“是”按钮
2. 放入linux 光盘，以fedora12 为例选择第一选择
可以跳过磁盘检测
 进入启动画面后点击Next，选择安装界面的语言
 输入计算机名
 选择系统时钟
 输入root 密码
 选择linux 系统安装磁盘位置
首先删除原有windows 分区
空间设置如下:
Swap 4g；Ext4 15g；Data 剩余空间
 点击next
 选择默认启动的操作系统
 安装成功后重启进入fedora 系统进行配置
 创建新用户
 检查日期时间
 按照默认选项完成即可
此时进入登录界面
3. 把AFNI 解压后，以root 账户运行afni，步骤如下：
 将从http://afni.nimh.nih.gov/afni 下载的源程序linux_gcc32.tgz ，解压至/usr/local/bin
目录下，
 从桌面打开终端,在#号后输入：cd /usr/local/bin/linux_gcc32 回车，再在#号后输入./afni
即可。
若提示如下错误： afni: error while loading shared libraries
可将libxp.so.6 文件下载安装
(http://www.rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=libXp.so.6)
重新运行./afni 即可
若root 账户不可用，需要修改配置文件，以fedora12 为例
su root 用户进入
cd etc
cd pam.d
首先以用户账号进入终端，允许root 账号登陆：
$ su
$ vi /etc/pam.d/gdm
删除其中的一行 auth required pam_succeed_if.so user != root quiet
保存并退出。
$ vi /etc/pam.d/gdm-passwaord
删除其中的一行 auth required pam_succeed_if.so user != root quiet
保存并退出。
4. R 安装
1) 首先到afni 网站http://afni.nimh.nih.gov/sscc/gangc/Rinstall.html 下载相应机器的R 安装包
2) 在R 安装文件相应路径依次执行以下命令：
 make
 make check
 make install
以上都执行成功后输入命令R 可以进行验证，再输入q()可以退出
附录5： 交通路线
图中B 点为中科院心理所位置
乘车路线：466、510、81 路坐到奥运村西
328、379、484、419、425、518、628、630、751、836、839、85、83、949、913、
运通110 坐到南沟泥河
附录6： 心理所周边招待所参考：
宾馆名称 电话 地址 房型和参考价位
七天连锁北沙滩店 (010)64870977 北京市朝阳区
北沙滩1 号
标间 238
商务大床 228
大床 208
经济房 188
亚奥国际大酒店
（劳动大厦）
(010)62021541 北京市朝阳区
北沙滩大屯路
甲1 号
标间 428
中科联招待所 (010)64845581 北京市朝阳区
南沙滩科学园
南里东街甲5
号2 楼
标间160,180
普通间120,130
北京禾融商务酒店 (010)51367088 北京市朝阳区
南沙滩1 号
标间 188
格林豪泰酒店 (010)52082998 北京市朝阳区
北沙滩2 号
标间 219
商务大床 219

sound nice ni :)

while less familiar with AFNI  

报过名了
不是说把AFNI得程序发过来吗
到现在都没有回应啊强烈要求有光盘