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    关系afni预处理的问题

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    选择 0滴只看楼主 老水滴资料 于2007-12-27 01:16     
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    hawkmu 溅出的水花儿: 本帖被 wonder 从 功能和磁共振(fMRI)高级讨论区 移动到本区(2007-10-21)




    用afni进行滤波处理时,
    to3d -prefix rhmw_N02 -view orig -xFOV 91.5R-91.5L -yFOV 127.5P-91.5A -zFOV 73.5I-109.5S -time:zt 61 170 2s altplus 3Df:-1:0:61:73:61:/media/DISK5//n_fMRI_02/rhmw*.img
    3dFourier -prefix /media/DISK1//N02/AFNIfile/rhmw_N02 -lowpass 0.08 -highpass 0.01 -ignore 1 rhmw_N02+orig.
    所生成的head文件里多了下面的5列不知是什么意思,请各位大侠指点


    name = IJK_TO_DICOM
    count = 12
    3 0 0 -90 0
    -3 0 126 0 0
    3 -72



    >>> 2007-05-06 09:45


    cell 溅出的水花儿: 还真没关注过这个
    等答案
    这五列是在做完滤波之后出来的吗
    而不是之前就有的?
    -90 126 -72可能是生成脑图的起始点坐标(ijk模式的)


    另问几个疑问
    ---------------------
    -xFOV 91.5R-91.5L -yFOV 127.5P-91.5A -zFOV 73.5I-109.5S
    ----------------
    为什么要设成这样的,一般y方向默认都是对称的,为什么你的是偏的,有何用意?


    -------------------
    -time:zt 61 170 2s altplus 3Df:-1:0:61:73:61:/media/DISK5//n_fMRI_02/rhmw*.img
    ---------------------

    zt 后的61是指的扫描层数吧, 怎能Z方向能扫这么多层,你那是多少T的机器扫描来的啊
    景仰,假如是的话
    假如不是就属我孤陋了
    现在很少用3Df:-1:0:61:73:61:这样的选项了
    查了一下,最后的61指的是number of images
    http://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/manual/to3d.pdf


    [ 此贴被cell在2007-05-06 15:53重新编辑 ]





    >>> 2007-05-06 15:12


    cell 溅出的水花儿: ---------------------
    -xFOV 91.5R-91.5L -yFOV 127.5P-91.5A -zFOV 73.5I-109.5S
    ----------------
    为什么要设成这样的,一般y方向默认都是对称的,为什么你的是偏的,有何用意?


    可能没问到点子上
    在这里你XY方向本来就不是正方矩阵,而是61*73
    感觉怪怪的^^

    >>> 2007-05-06 15:32


    新皮层 溅出的水花儿: Quote:引用第0楼hawkmu于2007-05-06 09:45发表的 关系afni预处理的问题 :
    用afni进行滤波处理时,
    to3d -prefix rhmw_N02 -view orig -xFOV 91.5R-91.5L -yFOV 127.5P-91.5A -zFOV 73.5I-109.5S -time:zt 61 170 2s altplus 3Df:-1:0:61:73:61:/media/DISK5//n_fMRI_02/rhmw*.img
    3dFourier -prefix /media/DISK1//N02/AFNIfile/rhmw_N02 -lowpass 0.08 -highpass 0.01 -ignore 1 rhmw_N02+orig.
    所生成的head文件里多了下面的5列不知是什么意思,请各位大侠指点

    .......

    也没有仔细关注过这个矩阵,不过应该是记录重建后的坐标位置变化。

    >>> 2007-05-06 17:22


    hawkmu 溅出的水花儿: 是一位朋友实验室帮我处理的,也不知道是怎么回事,回来自己处理的发现多了5列,而那位朋友又没联系上。感到希奇。
    多谢各位的指点

    >>> 2007-05-07 15:09


    cell 溅出的水花儿: 给我的感觉你这不是用来做人的^_^

    >>> 2007-05-08 22:17


    hawkmu 溅出的水花儿: 是人的,原始图像是64×64 20层。

    >>> 2007-05-09 10:55
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